- ソフト名 : CStone
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CStone 詳細説明
CSTRYは、BRUIJNのようなグラフを使用し、それが非キメラであることが保証されているかどうかを示す3つのグラフ分類レベルのうちの1つで生成された各コンテグで作成された各コンティグに注釈を付けるRNA-SEQデータのためのDE NOVOアセンブラです。分類レベルは、読み取りが由来する遺伝子ファミリーの複雑さに依存する。副産物として、これはまた配列決定された根本的な遺伝子ファミリーの構造化の洞察を提供する。それはシミュレートされたデータと実データの両方でテストされ、2つの広く確立されたDe Novo Assemblers TrinityとRnaspadesに対してベンチマークされています。さらなる詳細は私達の論文の中に間もなく利用可能になるでしょう。