次世代シーケンスデータにおけるバリアント検出
- ソフト名 : VarScan
- OS : Windows,Mac,Linux
- 言語 : Java
- 開発者 : HOME
VarScan 詳細説明
超並列配列決定における変種検出1つのサンプルでは、SNP、InDels、およびConsensus Gensionypesを呼び出します。腫瘍標準ペアの場合は、各変種を生殖細胞系、体細胞、またはLOHとしてさらに分類し、体細胞コピー数の変化も検出します。最新バージョンはGitHubで入手できます
次世代シーケンスデータにおけるバリアント検出
超並列配列決定における変種検出1つのサンプルでは、SNP、InDels、およびConsensus Gensionypesを呼び出します。腫瘍標準ペアの場合は、各変種を生殖細胞系、体細胞、またはLOHとしてさらに分類し、体細胞コピー数の変化も検出します。最新バージョンはGitHubで入手できます